| Outils du Calcul Scientifique | Méthodes Numériques pour le Calcul Haute Performance | Génie Logiciel II | Génie Logiciel I | Tutorat MAP431 | Tutorat MAP311 |
Cette page est dédiée à l’ensemble des cours dans lesquels je suis intervenu dans le cadre de mes 3 années de monitorat à l’Ecole Polytechnique, et de mon contrat d’A.T.E.R. à l’I.S.T.I.L.
ISTIL - MAM1 - Outils du Calcul Scientifique
- Un aide-mémoire pour faire des Makefile
- Un aide-mémoire FORTRAN 90
- Un aide-mémoire Gnuplot 4.0
- initiation LaTeX et document de travail src et pdf
ISTIL - MAM3 - Méthodes Numériques pour le Calcul Haute Performance
Utiliser M.P.I. sur les portables M.A.M.
L’implémentation M.P.I. installée sous linux sur les portables M.A.M. est MPICH2. A la différence de l’implémentation sur ouessant (version native de la distribution unix SGI).
On peut essayer de bricoler quelque chose qui devrait marcher, mais il vaut mieux s’attaquer au problème de fond : la version MPICH2 installée sur les portables n’est pas vraiment compatible avec Fortran 90. Il faut donc recompiler MPICH2 :
-
se placer dans le répertoire ~/mpich2-1.0.6pl ;
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exécuter la commande (une seule commande) :
FC="gfortran ${BUILD32}" CC="gcc ${BUILD32}" CXX="g++ ${BUILD32}" \
./configure --enable-cxx --enable-f77 --enable-f90
qui va préparer la recompilation de MPICH2 en précisant que l’on veut une version F77, une version F90 et une version C++; 3. exécuter la commande make pour recompiler MPICH2; 4. exécuter la commande make install pour réinstaller MPICH2.
Ceci étant fait, nous pouvons maintenant écrire les bonnes options de compilation dans le Makefile :
le LDFLAGS sera utilisé en remplacement du FFLAGS dans le linkage (la commande qui génère l’exécutable).
Il nous reste maintenant à modifier l’environnement de travail Unix pour que tout fonctionne :
- dans le fichier ~/.bashrc : ajouter l’instruction :
PATH=/usr/local/mpich2/bin/:${PATH}
- dans le répertoire racine ($HOME), créer un fichier .mpd.conf contenant :
MPD_SECRETWORD=mr45-j9z
- lancer la commande mpd & avant toute exécution de programme MPI
On peut alors utilise `use mpi`comme avant.
Transparents des séances de TPs MPI
Structure d’un programme parallèle de calcul scientifique
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Initialisation
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Voisinage
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Champs
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(Début de boucle) Calcul
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Communications (Fin de boucle)
Avec des communications bloquantes, les communications se font toujours après les calculs, pour synchroniser la mise à jour de toutes les valeurs.
ISTIL - MAM2 - Génie Logiciel I
ISTIL - MAM2 - Génie Logiciel II
Liens utiles pour Java
- L' A.P.I. de Java, la documentation de référence
- La page de Java Native Interface, pour interfacer Java avec C++.
- Java Developers Almanac 1.4, des exemples nombreux et variés de la plupart des classes Java.
Liens utiles pour BOUML
- La documentation en pdf doc2.30_A4.pdf
- Tutoriel en français : Premiers pas avec BOUML
- Tutoriel en français : Les classes et la génération de code
Ecole Polytechnique - Tutorat MAP 431
En tant que moniteur du cours MAP 431, voici quelques liens utiles :
- La page du cours MAP431.
- Besoin d’aide pour Scilab ? Un petit tutoriel est disponible ici.
- Besoin d’aide en Freefem++ ? Un petit tutoriel est disponible ici.
D’autres tutoriels et docs sont disponibles en cliquant sur docs et liens dans le menu.
Pour le cours de tutorat du jeudi 23 mars 2006, le sujet, ainsi que le fichier generatrices.txt. Une archive complète de l'énoncé et des corrections au format .tar.gz est disponible ici